A gyógyszeres gyökértömés a gyökérkezelés egyik köztes lépése, amikor a megtisztított gyökércsatornába gyógyszeres anyagot helyeznek. Ez segít a baktériumok elpusztításában, a gyulladás csökkentésében és a fertőzés kezelésében. A fogat ilyenkor ideiglenesen lezárják, majd a végleges gyökértömés későbbi alkalommal készül el.